InitalCommit

2025-11-16 10:30:26 +01:00
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commit d2e409d10f
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@@ -0,0 +1,57 @@
+using System;
+using System.Collections.Generic;
+using System.Linq;
+using System.Text;
+using System.Threading.Tasks;
+
+namespace BaseCellSimulation.Enzyms.Cytosol
+{
+    public class AdenylateKinase : InternalEnzym
+    {
+        public AdenylateKinase() 
+        {
+            Km = 0.1;
+            Vmax = 5;
+            Keq = 1.1;
+
+            KmRange = new(0.01, 0.5);
+            VmaxRange = new(0.5, 15);
+            KeqRange = new(0.9, 1.2);
+        }
+
+        public double Keq { get; set; }
+
+        public ValueRange KeqRange;
+
+        public override void ApplyChanges(CellRessources res, double dt)
+        {
+            double d = rate * dt;
+
+            // Begrenzen, damit keine negativen Konzentrationen entstehen
+            if (d > 0.0)
+            {
+                // Vorwärtsrichtung: 2 ADP -> ATP + AMP
+                double limit = Math.Min(res.Res.Energy.ADP / 2.0, d);
+                res.Res.Energy.ADP -= 2.0 * limit;
+                res.Res.Energy.ATP += limit;
+                res.Res.Energy.AMP += limit;
+            }
+            else if (d < 0.0)
+            {
+                // Rückwärtsrichtung: ATP + AMP -> 2 ADP
+                double limit = Math.Min(Math.Min(res.Res.Energy.ATP, res.Res.Energy.AMP), -d);
+                res.Res.Energy.ADP += 2.0 * limit;
+                res.Res.Energy.ATP -= limit;
+                res.Res.Energy.AMP -= limit;
+            }
+        }
+
+        public override void ComputeRate(Resources res)
+        {
+            double numerator = res.Energy.ADP * res.Energy.ADP - res.Energy.ATP * res.Energy.AMP / Keq;
+            double denominator = Km * Km + res.Energy.ADP * res.Energy.ADP;
+
+            rate = Vmax * (numerator / denominator); // Nettoreaktionsrate in mM/s
+        }
+    }
+}